ערכת גילוי מוטציות בגן 29 של EGFR אנושי (PCR פלואורסצנטי) - RUO
שם המוצר
ערכת גילוי מוטציות בגן 29 של EGFR אנושי (PCR פלואורסצנטי) - RUO
אֶפִּידֶמִיוֹלוֹגִיָה
סרטן ריאות הפך לגורם המוביל למוות מסרטן ברחבי העולם, ומאיים קשות על בריאות האדם. סרטן ריאות מסוג תאים שאינם קטנים מהווה כ-80%-85% מחולי סרטן ריאות. EGFR הוא כיום המטרה המולקולרית החשובה ביותר לטיפול בסרטן ריאות מסוג תאים שאינם קטנים. זרחון של EGFR יכול לקדם צמיחת תאי גידול, התמיינות, פלישה, גרורות, מניעת אפופטוזיס ולקדם אנגיוגנזה של הגידול. מעכבי טירוזין קינאז (TKI) של EGFR יכולים לחסום את מסלול האיתות של EGFR על ידי עיכוב אוטופוספורילציה של EGFR, ובכך לעכב את התפשטות והתמיינות של תאי גידול, לקדם אפופטוזיס של תאי גידול, להפחית אנגיוגנזה של הגידול וכו', על מנת להשיג טיפול ממוקד גידול [1]. מספר רב של מחקרים הראו כי היעילות הטיפולית של EGFR-TKI קשורה קשר הדוק למצב המוטציה בגן EGFR, ויכולה לעכב באופן ספציפי את צמיחתם של תאי גידול עם מוטציה בגן EGFR [2,3]. הגן EGFR ממוקם על הזרוע הקצרה של כרומוזום 7 (7p12), באורך מלא של 200Kb והוא מורכב מ-28 אקסונים. אזור המוטציה ממוקם בעיקר באקסונים 18 עד 21, מוטציית המחיקה של קודונים 746 עד 753 באקסון 19 מהווה כ-45% והמוטציה L858R באקסון 21 מהווה כ-40% עד 45% [4]. הנחיות ה-NCCN לאבחון וטיפול בסרטן ריאות שאינו תאים קטנים קובעות בבירור כי נדרשת בדיקת מוטציה בגן EGFR לפני מתן EGFR-TKI. ערכת בדיקה זו משמשת להנחיית מתן תרופות ממשפחת מעכבי טירוזין קינאז קולטן גורם גדילה אפידרמלי (EGFR-TKI), ומספקת את הבסיס לרפואה מותאמת אישית לחולים בסרטן ריאות שאינו תאים קטנים. ערכה זו משמשת רק לגילוי מוטציות נפוצות בגן EGFR בחולים בסרטן ריאות שאינו תאים קטנים. תוצאות הבדיקה הן לצורך עיון קליני בלבד ואין להשתמש בהן כבסיס בלעדי לטיפול אישי בחולים. על הרופאים לשקול את מצבו של המטופל, את התוויות התרופה ואת הטיפול. התגובה, אינדיקטורים אחרים של בדיקות מעבדה וגורמים אחרים משמשים לשיפוט מקיף של תוצאות הבדיקה.
עָרוּץ
| בופר תגובה | עָרוּץ |
| בופר תגובת EGFR IC | ערוץ FAM |
| בופר תגובה L858R | ערוץ FAM |
| בופר תגובה 19del | ערוץ FAM |
| בופר תגובה T790M | ערוץ FAM |
| בופר תגובה G719X | ערוץ FAM |
| בופר תגובה 3Ins20 | ערוץ FAM |
| בופר תגובה L861Q | ערוץ FAM |
| בופר תגובה S768I | ערוץ FAM |
פרמטרים טכניים
| אִחסוּן | נוזל: ≤ -18℃ בחושך |
| חיי מדף | 12 חודשים |
| סוג הדגימה | רקמת גידול טרייה, חתך פתולוגי קפוא, רקמה או חתך פתולוגי משובצים בפרפין, פלזמה או סרום |
| CV | <5.0% |
| אישור חוק (LoD) | גילוי תמיסת תגובת חומצות גרעין על רקע של 3 ננוגרם/μL מסוג בר, יכול לזהות ביציבות שיעור מוטציה של 1%. ב) תגובת חומצות גרעין תחת קצב מוטציה של 1%, ניתן לזהות ביציבות מוטציה של 1×103 עותקים/מ"ל ברקע הבר של 1×105 עותקים/מ"ל; ג) תמיסת התגובה הפנימית של הייחוס יכולה לזהות את תוצר הייחוס SW3 עם גבול הגילוי הנמוך ביותר של הייחוס הפנימי של הארגון. כאשר הערכה מזהה את חומר הייחוס בעל גבול הגילוי הלאומי, ניתן לזהות ביציבות את חומר הייחוס בעל גבול הגילוי של תדירות המוטציה של 2.5% ואת מוטציית הגברת הגן EGFR עם וריאציה של מספר העותקים של 4. |
| ספֵּצִיפִיוּת | אין תגובה צולבת עם DNA גנומי אנושי מסוג בר וסוגים מוטנטיים אחרים |
| מכשירים רלוונטיים | מערכות PCR בזמן אמת של Applied Biosystems 7500, מערכות PCR בזמן אמת של Applied Biosystems 7300, מערכות PCR בזמן אמת של QuantStudio® 5, מערכת LightCycler® 480 PCR בזמן אמת, מערכת PCR בזמן אמת מדגם BioRad CFX96. |
זרימת עבודה
ריאגנטים נדרשים אך לא מסופקים:מים ללא DNase/RNase, אתנול נטול מים. בעת בדיקת דגימת רקמה משובצת בפרפין, מומלץ להשתמש בערכת QIAamp DNA FFPE Tissue Kit (56404) של QIAGEN ובערכת Raiping Rapid DNA Tissue DNA משובצת בפרפין (DP330) של Tiangen Biotech (Beijing) Co., Ltd.. בעת בדיקת דגימת פלזמה/סרום, מומלץ להשתמש בערכת Macro & Micro-Test General DNA/RNA Kit (HWTS-3019-50, HWTS-3019-32, HWTS-3019-48, HWTS-3019-96) (שניתן להשתמש בה עם Macro & Micro-Test Automatic Nucleic Acid Extractor (HWTS-3006C, HWTS-3006B)) של Jiangsu Macro & Micro-Test Med-Tech Co., Ltd. או בערכת QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (55114) של QIAGEN.
חומרים מתכלים נדרשים אך לא מסופקיםקצוות צנטריפוגה ללא DNase/RNase, כפפות חד פעמיות, צינור צנטריפוגה ללא DNase/RNase, רצועות של 8 צינורות ל-PCR, צנטריפוגה.








